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五指山小型猪PPARγ2基因启动子多态性分析

2018年10月10日 浏览量: 评论(0) 来源:中国比较医学杂志2018年第9期 作者:潘金春 闵凡贵 王希龙 责任编辑:admin
摘要:对五指山小型猪PPARγ2基因启动子调控区域多态性进行分析。

目的:对五指山小型猪PPARγ2基因启动子调控区域多态性进行分析。

方法:根据猪PPARγ2启动子调控区域2200bp设计5对引物,对57头封闭群五指山小型猪的多态性进行检测,并用多种生物信息学软件对调控区域的启动子、转录因子结合位点、RNA二级结构、CpG岛进行预测分析。

结果:筛选到9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,分别是:-1595T/C、-1534G/A、-1262C/A、-1220C/A、-1017A/G、-963A/G、-955G/A、-866A/G、-333G/A。SNPs都没有处在软件识别的启动子区域中,但-333G/A突变位于核心启动子(-656~-23bp)区域。突变的SNP位点附近转录因子结合位点会发生改变,突变前后RNA二级结构最小自由能发生变化,其结构也发生显著变化。目标序列未找到CpG岛。

结论:筛选到的五指山小型猪PPARγ2启动子调控区域SNPs可能对该基因的表达调控产生影响,为进一步研究其功能奠定基础。

全文阅读:五指山小型猪PPARγ2基因启动子多态性分析

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