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知否知否,你的小鼠叫啥

2019年03月13日 浏览量: 评论(0) 来源:赛业生物 作者:赛业生物 责任编辑:admin
摘要:小鼠:铲屎的,别叫我尼古拉斯.赵四!要脸!

养了那么久的小鼠,大家都是怎么称呼自己养的小鼠呢? 全名叫起来啰嗦,这就是你们叫我小黑的理由?

平时不管你怎么称呼你的小鼠都没关系,但是写论文的时候就不能这么随意了。今天就让我们一起来学习一下小鼠的命名规则吧。这期我们先从野生型小鼠的命名下手,下期再详讲名字贼长的基因工程小鼠的名字含义。

  1. 小鼠命名的需要

举个栗子,假如一个南方人读了一个北方人写的一篇文献,使用了地瓜做实验,可是南方人和北方人眼中的地瓜可不是同一个物种,这样一来,他们的实验操作都一样,而结果却有可能完全不同。争论再多也不能确定谁是对的,事实上,或许他们的结论都是对的。由此可见,标准的命名规则,可以避免研究工作中因使用动物不明确而出现的混乱情况,使得研究结果具有重复性或可比性。

全名叫起来啰嗦,这就是你们叫我小黑的理由?

  1. 小鼠的遗传学分类

为什么要讲小鼠的遗传学分类?因为这和小鼠的命名有关。

根据遗传特点的不同,实验动物分为近交系、封闭群和杂交群。按基因纯合程度,可分为相同基因类型和不同基因类型两大类。

全名叫起来啰嗦,这就是你们叫我小黑的理由?

  1. 近交系小鼠的命名

3.1近交系(Inbred Strains)的定义

至少经过20代以上的连续全同胞交配或亲子交配,品系内所有个体都可追溯到起源于第20代或以后代数的一对共同祖先的动物群。在一个动物群体中,任何个体基因组中99%以上的等位位点为纯合时定义为近交系。通常所讲的近交系是指普通近交系。

3.2亚系( Substrains)

育成的近交系可能由于残余杂合性、突变或遗传污染(即一个近交系与非本品系动物杂交而引起的遗传改变)而导致部分遗传组成的改变,从而形成亚系。

3.3近交系的命名

近交系以简短的符号命名,该符号一般是大写英文字母,也可以是英文字母加阿拉伯数字:

  • 一般用1-4个大写英文字母表示:A、AE、DBA、STAR等
  • 大写字母加1-2个阿拉伯数字:C57BL、C3H等
  • 不符合规定,但被国际广泛承认而沿用:615、129等
  • 关系相近、同来源的不同品系,其名称基本相似,差异部分用一个不同的大写英文字母表示:NZB, NZC, NZO
  • 如果需要表示近交代数,一般用大写字母F(Flial)加代数表示,比如A(F78)。若是资料不全可写上已知代数,在前面加?,如AKR(F?+10);若是从其他实验室引入,又经自己培育若干代,则先标明引入时的子代数,再加上自己饲养的代数,如C57BL/Jnc:a(F73+26)。

常见的近交系名称缩写:

BALB/c→C  C57BL→B  C57BL/6→B6  DBA/1→D1

3.4近交系亚系命名

在原品系后加“/”,再在后面加上亚系代号。代号通常是培育该品系的研究者或实验室代码,比如A/He表示由Heston博士培育的A品系的亚系;可以是数字,比如C57BL/6和C57BL/10表示C57BL的两个亚系;也可以是数字加研究者或实验室代码,比如C57BL/6J和C57BL/10J表示由美国杰克逊实验室维系的C57BL的两个亚系。也有后标小写字母的历史沿用的亚系,比如BALB/c。有些近交系的不同亚系之间遗传差异较大,因此在论文中应标明所使用的亚系名称。

通过不同的研究者的持续维持或通过建立新的群体,亚系可以进一步产生新的亚系。在老亚系的名称后面加上新亚系代号,比如FVB/NTac,表示Taconic biosciences维持的FVB/N亚系。

常见的亚系代号:

He:美国国立肿瘤研究所的W.E.Heston博士

J或Jax:The Jackson Laboratory

Tac:Taconic biosciences

N或NIH:美国国立卫生研究院

Crl:The Charles River Laboratory

Cyagen:赛业生物

  1. 杂交群的命名

4.1杂交群(Hybrids)的定义

指由不同品系或种群之间杂交产生的后代,实验动物学所说的杂交群通常是杂交F1代动物。

4.2命名

母本名称在前,父本名称在后,名称可用通用缩写表示,二者之间以大写的英文字母“X”相连表示杂交,将以上部分用括号括起,再在其后标明杂交的代数。比如(DBA/2 x C57BL/6J)F1,表示母本是DBA/2,父本是C57BL6/J,杂交代数为1,可简写为D2B6F1。

注意:母本名称和父本名称顺序,B6D2F1与D2B6F1在遗传上是不同的,它们的父本和母本对调。

  1. 封闭群(Outbreds)的命名

5.1定义

ICLAS(国际实验动物科学委员会)规定,以非近亲交配方式进行繁殖生产的一个种群,在不从外部引入新的血缘条件下,至少连续繁殖4代以上称为封闭群。保持了群体的一般遗传特征,又具有杂合性。

5.2命名

(1)  一般以2-4个大写英文字母命名,如NIH小鼠。

(2)种群保持者名称:种群名称,这是封闭群动物与近交系动物命名的最大区别。种群保持者名称为1-4个英文字母的缩写,首字母大写,其余小写。如N:NIH,表示美国卫生研究院(N)保持的NIH小鼠。

(3)历史沿用名称。如:ddy封闭群小鼠。

(4)突变种的命名是在封闭群命名的基础上加上突变基因的符号,用连字符相连,基因符号用斜体字。如:N:NIH -nu/nu,表示由美国国立卫生研究院保存的,带有纯合裸基因的NIH小鼠。

关于野生型小鼠的命名就讲这么多了,希望对你理解某些小鼠的名字有所帮助,我们下期会接着详讲基因工程小鼠的命名。

参考资料:

1.何诚主编,实验动物学 第2版=LABORATORY ANIMAL SCIENCE,中国农业大学出版社,2013.02,第35页。

2.王俊霞,刘健敏主编,实验动物质量控制,河北科学技术出版社,2014.08,第14页

3.http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/strains.shtml

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