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小鼠后肢特异表达基因的筛选及验证

2019年05月24日 浏览量: 评论(0) 来源:实验动物与比较医学2019年第1期 作者:王茂春 段维旺 李凯 周宇荀 肖君华 责任编辑:admin
摘要:对比小鼠前后肢基因表达谱的变化,筛选小鼠后肢特异表达的基因。

目的:对比小鼠前后肢基因表达谱的变化,筛选小鼠后肢特异表达的基因。

方法:通过NCBIGEO 数据库查找小鼠前后肢基因表达芯片,使用Transcriptome Analysis Console软件对原始数据(5个前肢E10.5d芯片 及4个后肢E10.5d芯片)进行质控,利用差异倍数为2倍以上或0.5倍以下及P 值小于0.05进行数据过滤,绘制 差异表达基因的火山图,并进行聚类分析,构建后肢特异表达基因的相互作用分子网络图。

结果:小鼠胚胎E10.5 d后肢相较于前肢的差异表达的基因共有275个,其中上调的基因45个,下调的基因230个,构建了后肢特异表达 的差异基因分子网络图,找到后肢特异表达核心基因,使用qPCR检测部分后肢特异表达的基因,结果与芯片结果 一致。

结论:应用小鼠表达谱芯片成功筛选出后肢特异表达的基因,为哺乳动物肢体发育的研究提供基础。 

全文阅读:小鼠后肢特异表达基因的筛选及验证 

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