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西藏小型猪多组织组蛋白修饰谱研究

2019年06月11日 浏览量: 评论(0) 来源:中国比较医学杂志2019年第5期 作者:陈娜 刘闻 秦锐 于欣鑫 顾为望 高飞 责任编辑:admin
摘要:对西藏小型猪全基因组范围内的组蛋白修饰位点进行注释,并比较不同组织间组蛋白修饰的差异。

目的:对西藏小型猪全基因组范围内的组蛋白修饰位点进行注释,并比较不同组织间组蛋白修饰的差异。

方法:取三月龄的雄性非同胎西藏小型猪两只,分别取其血液、肝、小肠(回肠段)和背最长肌的组织样 本,进行染色质免疫共沉淀实验,捕获DNA片段进行高通量测序。 下机数据经过滤后比对到参考基因组上,并使 用MACS软件统计reads在基因组上的富集情况。

结果:不同组蛋白在基因启动子区域分布的偏好位置不同,分 布规律大致分为两类,一类如H3K4me3组蛋白修饰主要分布在转录起始位点附近的两侧,并在距离TSS较近的下 游位置出现一个宽度较窄的明显的峰值,另一类如H3K9me3组蛋白修饰在整个启动子区域内分布较为平均,整体 呈现出中间低两边高的宽峰形状;组织特异性组蛋白修饰影响的基因存在差异,对应的功能通路比较广泛,但都参 与了RNA聚合酶II启动子的转录调控。

结论:本研究提供了西藏小型猪四种组织的组蛋白修饰注释数据,为今 后以西藏小型猪为生物医学模型的转录调控研究提供了基础数据。

全文阅读:西藏小型猪多组织组蛋白修饰谱研究 

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